他所著的《備急千金要方》，簡稱《千金要方》，共三十卷，內(nèi)容極為豐富。分醫(yī)學(xué)總論、婦人、少小嬰孺、七竅、諸風(fēng)、腳氣、傷寒、內(nèi)臟、癰疽、解毒、備急諸方、食治、平脈、針灸等，共計二百三十二門，收方五千三百首。特別值得注意的是，書中首創(chuàng)“復(fù)方”�！秱摗返捏w例是一病一方，而孫思邈在《千金要方》中發(fā)展為一病多方，還靈活變通了張仲景的“經(jīng)方”。有時兩三個經(jīng)方合成一個“復(fù)方”，以增強治療效果；有時一個經(jīng)方分成幾個單方，以分別治療某種疾病。這是孫思邈對醫(yī)學(xué)的重大建樹，是我國醫(yī)學(xué)史上的重大革新。《千金翼方》是對《千金要方》的補編。書名含有和《千金要方》相輔相濟，羽翼雙飛的意思。此書共三十卷，其中收錄了唐代以前本草書中所未有的藥物，補充了很多方劑和治療方法。首載藥物八百余種。這兩部書，合稱為《千金方》，收集了大量的醫(yī)藥資料，是唐代以前醫(yī)藥成就的系統(tǒng)總結(jié)，也是我國現(xiàn)存最早的醫(yī)學(xué)類書，對學(xué)習(xí)、研究我國傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)有重要的參考價值。宋代郭思高度評價《千金方》，說：“世皆知此書為醫(yī)經(jīng)之寶”（《千金寶要》）。清代醫(yī)學(xué)家徐大椿也認為該書“用意之奇，用藥之功，亦自成一家，有不可磨滅之處”（《
醫(yī)學(xué)源流論》）。這書不僅在國內(nèi)受歡迎，而且還影響到國外，如朝鮮，日本。公元六O八年，日本來中國學(xué)醫(yī)的醫(yī)生，就把《千金方》等方帶回日本，對日本的漢醫(yī)影響深遠。
由于孫思邈結(jié)合實踐，虛心地廣泛地學(xué)習(xí)各家之長，所以醫(yī)學(xué)水平很高，有許多獨特的貢獻。其中，對腳氣病的治療最為擅長。腳氣病是由于人體缺乏維生素B引起的。這種病多少年來折磨著江南一帶群眾。孫思邈在學(xué)習(xí)前人和總結(jié)群眾經(jīng)驗的基礎(chǔ)上，經(jīng)過長期探索，終于提出一個有奇效而又簡便的防治方案，那就是用防己、細辛、犀角、蓖麻葉、蜀椒、防風(fēng)、吳茱萸等含有維生素B1的藥物來治療，用含有維生素B1的谷皮（楮樹皮）煮湯調(diào)粥常服來預(yù)防，這在世界醫(yī)學(xué)史也是非常先進的。歐洲于公元一千六百四十二年，開始作腳氣病的研究，而孫思邈早在公元六百年左右，已經(jīng)詳加論述，并掌握了正確的防治方法，比歐洲早了整整一千年。
孫思邈特別重視婦幼保健，是創(chuàng)建婦科的先驅(qū)。他在《千金要方》中首例婦科三卷，兒科一卷，把婦兒科放在突出的地位。他還打破當(dāng)時醫(yī)學(xué)界“各承一業(yè)”的陋習(xí)，主張用綜合療法治病。他說：“良醫(yī)之道，必先診脈處方，次即針灸，內(nèi)外相扶，病必當(dāng)愈”。他本人用藥、用針、用灸都很精熟，對病人，不問“貴賤貧富”，不分“晝夜寒暑，饑渴疲勞，一心趕救”。一次，他在路上看到幾個人抬著棺材在前面走，從棺材里滴出幾點鮮血，后邊跟著一個老婆婆，傷心大哭。這種情況引起他的注意。一問，才知道棺材里的“死人”是老婆婆難產(chǎn)剛死的獨生女兒。他告訴老婆婆，產(chǎn)婦并沒有死。于是開棺搶救。一看，產(chǎn)婦臉色蠟黃，一絲血色也沒有，同死人無異，但一摸脈搏還在微微的跳動。孫思邈選定穴位，只扎了一針，不一會，產(chǎn)婦就蘇醒過來，胎兒也順利下產(chǎn)。眼看母子得救，大家十分感激，齊聲稱贊他的醫(yī)術(shù)高明�！稓v代名醫(yī)圖贊》稱道：“唐孫真人，方藥絕倫，扶危拯弱，應(yīng)效如神”（《本草蒙筌》）。
孫思邈在生之年為醫(yī)藥事業(yè)作了那么多重大的貢獻，臨終時，卻遺囑“薄葬，不藏明器，祭去牲牢”。這種精神是很可貴的。他深受人民的愛戴和敬仰。他的家鄉(xiāng)人民給他修廟立碑，把他隱居過的“五臺山”改名為“藥王山”。山上至今保留有許多有關(guān)孫思邈的古跡，如“藥王廟”、“拜真臺”、“太玄洞”、“千金寶要碑”、“洗藥池”等。這也說明歷代人民對他的感情是多么深厚。
